于是乎,我就想到了python里极为强大的一个分子生物学库:biopython。嘿,真别说,官方中文文档里还真出现了这么一个东西----BioSQL。 因为BioSQL是需要基于其他数据库来运行,这里我们以MySQL为例 首先,传统艺能,...
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生物信息学教学资料:生物信息学常用数据库.ppt
标签: 大数据
蛋白质分类数据库作为生物学数据库中的一部分,对于研究人员和生物工程领域非常重要。 ### 现有的生物学数据库 目前,已经存在许多生物学数据库,其中包括基因组数据库、蛋白质序列数据库、代谢通路数据库等等。...
标签: 大数据
在过去的几十年里,随着生物学和计算机科学的融合,生物信息学领域迅速发展。生物学数据库的建立和应用成为了生物科学研究中不可或缺的一部分。其中,DNA序列数据库作为生物学数据库中的重要组成部分,发挥着至关...
标签: 大数据
介绍生物学数据库 ## 1.1 生物学数据库的概念和作用 生物学数据库是指存储、管理和提供生物学相关数据的系统。它们起到了整合、保存和传播生物学数据的重要作用。生物学数据库可以包含各种类型的数据,例如基因...
标签: 大数据
生物学数据库是由大量生物信息数据组成的集合,包括了各种生物分子的序列、结构、功能和相互关系等信息。这些数据对于研究生物学中的基本生物学问题、进化和系统生物学、药物设计和开发以及疾病诊断和治疗等领域都...
二级核酸数据库:是通过对一级数据中数据的分析整理归纳注释构建的具有特殊生物学意义和专门用途的数据库。如从三大核酸数据库和基因组数据库中提取并加工出的果蝇和蠕虫数据库。 蛋白质数据库 一级蛋白质数据库:...
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生物信息学及其相关数据库
生物学数据库在生物科学研究和生物技术应用中起着重要的作用。它们提供了大量的基础数据,为研究人员提供了丰富的资源和工具。生物学数据库广泛应用于以下领域: - 基因组学:研究基因组中的基因组成和功能。 - ...
标签: 大数据
图数据库作为一种新兴的数据库技术,在生物信息学中展示了巨大的潜力。图数据库采用图的存储结构,在处理生物学中的复杂关系和网络时具有独特的优势。它可以高效地存储和查询生物网络数据,并支持复杂的图算法和网络...
生物信息学专业,GEO数据库挖掘进行ID转换时,常用的GPL平台对应的BIOconductor的R包总结
[b]综合数据库[/b] ★ INSD,国际核酸序列数据库(International Nucleotide Sequence ...★ EMBL库,欧洲分子生物学实验室的DNA和RNA 序列库。 http://www.ebi.ac.uk/embl.html ★ GenBank ,美国国家生物...
生物信息学是一个跨学科的领域,融合了生物学、计算机科学和统计学的知识,旨在利用计算机和统计学方法来处理和分析生物学数据。随着高通量测序技术的快速发展,大量的基因数据不断产生,给研究人员带来了巨大的挑战...
生物信息学中的序列比对
标签: 文档
生物信息学相关数据库资源介绍.ppt
概述了几种主要的生物信息学数据库,包括核酸序列、蛋白质序列及其结构和专用生物路径数据库。文章从一级核酸数据库开始,详细介绍了GenBank、Ensemble和JCVI等数据库,这些数据库提供了广泛的原核和真核生物的遗传...
生物信息的发展为解析数据提出假说提供了很好的技术手段; 数据有了,分析结果有了,文章发表了,皆大欢喜。 然后呢?为我们出力的数据怎么处理? 鸟尽弓藏,兔死狗烹? 让他们蜷缩在Excel里? 让他们沉睡在服务器上...
生物信息学6二级数据库及数据库的格式[课件资料]
生物信息学专业MySQL数据库课程教学方法探讨.pdf
生物信息学 8.农业类数据库的利用
生物信息学第十四章 提交DNA序列到数据库
标签: 数据库
基于GEO数据库线粒体脑肌病伴高乳酸血症和卒中样发作芯片数据的生物信息学分析.pdf
生物信息学 4.核苷酸和蛋白质序列为基础的数据库检索
标签: 首发论文
生物信息学的现状与未来,郑伟国,郭英,生物信息学已成为整个生命科学发展的重要组成部分,成为生命科学研究的前沿。本文对生物信息学研究对象、重要技术、数据库建设及
1、整理的关于微生物扩增子方面的数据库,包括常用的Silva、GreenGene、RDP以及ITS库UNITE; 2、抗体、病原体相关数据库。