生物信息学常用数据库
标签: 生物信息学
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它们来源于MEDLINE(生物医学文献数据库)、生命科学领域数据杂志以及在线的专业书籍。PubMed链接:在PubMed中进行搜索:关于PubMed搜索的相关内容,通过WoS的知识进行理解。(后续会更新WoS搜索相关文章)
经过去批次效应,标准化处理的单细胞数据库,包括约800个细胞的20000个基因表达谱,收录了T-cell, B-cell,NK-cell,Astrocyte-cell等。 数据库为Rdata格式,需要简单的R语言基础,已经附带api及说明书,方便数据库...
目的是通过提供在线生物学数据和生物信息学分析工具来帮助人类更好的认知生物学问题。 目前有将近40个在线的文库和分子生物学数据库,包括:PubMed, PubMed Central, and GenBank等。网址: ...
生物信息学数据库生物信息学数据库
生物信息学数据库分类概览 Meta databases Model organism databases Nucleic acid databases 3.1 DNA databases 3.2 Gene expression databases (mostly microarray data) 3.3 Phenotype databases 3.4 ...
山东大学生物信息学课件03生物信息学数据库及检索策略.pptx
BeeDeeM :生物信息学数据库管理系统 BeeDeeM是一个通用的乙ioinformatics d atabank中号anager。 它提供了一套命令行和UI软件,用于安装和使用主要序列数据库和生物学分类。 它是的理想伴侣。 主要特点 BeeDeeM...
肿瘤生物信息学数据库.docx
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生物信息学数据库检索
生物信息学数据库综述
常用生物信息学数据库和分析工具网址.pdf
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生物信息学数据库(二)
生物信息学数据库列表[收集].pdf
7 生物信息学数据库(PPT-76)
生物与计算机的结合让生物进入大数据时代,为方便管理各种生物数据,科学家们开发了各式各样的生物数据库。了解与自己研究领域相关的数据库,并加以利用可能会使研究工作得到事半功倍的效果。在此将常用数据库按照...
综合数据库 ★ INSD,国际核酸序列数据库(International Nucleotide Sequence ...★ GenBank ,美国国家生物技术信息中心 (NCBI)所维护的供公众自由读取的、带注释的DNA序列的总数据库。http://www.ncbi.nlm....
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生物信息学常用常见的数据库和在线分析工具,以及文献检索工具
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生物信息学是一个新的研究领域,现在发展的快,很有前途!
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生物信息学习者的必备...目前网络上存在许多的生物学数据库,往往可以通过多个站点对同一数据库及其镜象站点进行访问,根据不同的需要使用不同的数据库。本资料介绍的就是一些常用数据库,以方便生物信息学习者参考。
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为保证数据尽可能的完全,GeneBank与EMBL(欧洲EMBL-DNA数据库)、DDBJ(日本DNA数据库)共同构成国际核酸序列数据库合作联盟(INSDC),三大数据库的信息每日相互交换,更新汇总。数据库中四种结构分类层次分别是:...
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核苷酸序列数据库: [1] Genbank [2] EMBL [3] DDBJ [4] Ensembl [5] 表达序列标记数据库dbEST ... [1] 蛋白质信息数据库PIR [2] SWISS-PROT [3] TrEMBL 生物大分子数据库: [1] PDB [...
文章目录核酸数据库非编码RNA数据库1.非编码小RNA数据库2.长非编码RNA数据库:3.非编码RNA家族数据库4....代谢组学常用数据库3.表型数据库序列比对1.序列与数据库比对2.多序列间比对3.序列进化树分析基因分析0.基因...
做数据分析常常会需要用到参考基因组和注释文件,还会需要分析公共数据,了解常见的生物信息学数据库资源也是非常有必要的!故本章首先介绍常用的参考基因组和注释文件,然后介绍生物信息常用的数据库资源如:...
目前生物学数据库的四种类型:平面文件、关系型数据库、面向对象数据库和基于Internet平台的XML。 人类基因组计划的主要目标:获取... 了解重要的生物信息学门户站点:NCBI、EBI、EMBnet 利用Nucleic Acid Research
蛋白质的空间结构是其行使功能的基础,所以蛋白质既有序列数据库还有结构数据库。 蛋白质序列数据库 蛋白质序列数据库有很多,如SwissProt,TrEMBL,Pir等。 Pir是世界上第一个具有分类和功能注释的蛋白质序列...
综合数据库 ★ INSD,国际核酸序列数据库(International Nucleotide Sequence ...★ EMBL库,欧洲分子生物学实验室的DNA和RNA 序列库。 http://www.ebi.ac.uk/embl.html ★ GenBank ,美国国家生物技术信