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     前言 NGS系列文章包括NGS基础、转录组...(重磅综述:三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程 (原理、代码和评述))、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据挖掘(典型医学设计实验GEO数据分析 (step-by-ste...

     这一期的内容比较多,涉及了实操和原理部分。部分只是想使用软件的同行来说,可以只看实际操作的代码部分。...这一期的内容比较多,涉及了实操和原理部分。部分只是想使用软件的同行来说,可以只看实际操作的代码部分。...

     第1章 数据质量整体概述 1.1 概述 1.2. 数据质量标准分类 1.3 数据质量管理解决方案 第2章 ODS层数据校验 2.1 数据校验通用脚本 2.2 ODS层各表检验 第3章 DWD层数据校验 3.1 数据校验通用脚本 3.2 DWD层各...

     背景 前面介绍了如何从sra文件得到fastq文件 [Linux|生信]project4_01:...一:质控前的初步看测序数据质量:fastqc与multiqc# 1.激活前面生成的虚拟环境,进行fastqc与multiqcconda activate biotre

     自己的学习笔记,欢迎各路大神批评指正 plink文件类型 Plink常见格式有五种:ped,map,bed,fam,bim PLINK接受VCF文件作为输入,但在PLINK中使用的首选格式是带有结尾.ped(和.map)的文件,以及带有结尾.bed(+ ...

     trimmomatic处理Illumina 平台产生的fastq数据,支持fastq以及gzip 和 bzip2 压缩文件。 1. 处理PE数据 trimmomatic PE test_read1.fq test_read2.fq \ -phred33 \ out_read1.fq test_read1_unpaired.fq \ out...

     包括选择使用有证标准物质作为实验室质控样品、确定控制图的类型、建立控制限以及确定控制分析的频度等,并采用日常质控图对煤中全硫、挥发分、发热量、氢等检测项目进行数据分析统计,以判断测试系统是否稳定可靠。...

     早上联系到林同学,这厮除了骄傲地告诉俺他的论文答辩社会实践各等成绩校三好等破事外,重点知道了他目前在做关于数据质量控制的研究,并且下决心搞出点成绩。他的课题正好和俺目前做的事非常相似,我也是一有时间就...

     三代测序数据分析实战 主讲人:徐怡 浙江大学医学院博士,迪安诊断研发中心生物信息工程师,负责 NGS 遗传检测。 背景介绍 从1977年第一代DNA测序技术(Sanger法)发展至今三十多年时间,测序技术已取得了相当...

     目录 1.什么是数据质量,我们遇到了什么问题 2.数据质量的问题和根源 2.1业务源系统变更 2.2 数据开发任务变更 ...2.3 物理资源不足或者基础设施不...发现数据问题,但是数据问题源头排查耗时长,导致数据长时间不可

     1)fastp介绍 fastp文献 fastp下载 fastq文件处理工具,基于C 2)功能 多线程 去接头 碱基矫正 根据滑动窗口质量值剪切 切ployG/ployX尾巴 处理分子标签(UMI) 分割输出结果 ...质控结果报告 ...

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