FastQC是一种质量控制分析工具,旨在发现高通量测序数据集中的潜在问题。 它的目标是提供一种简单的方法来检查来自高通量测序管道的原始序列数据的质量。 它通过对一个或多个fastq或bam格式的原始序列文件运行一组...
FastQC是一种质量控制分析工具,旨在发现高通量测序数据集中的潜在问题。 它的目标是提供一种简单的方法来检查来自高通量测序管道的原始序列数据的质量。 它通过对一个或多个fastq或bam格式的原始序列文件运行一组...
基于德尔菲法和层次分析法的现代医院门诊医疗质控指标体系构建与应用.pdf
同时满足miRBase、miRTarBase和miRDB三个数据的物种,只有5种。因此针对未知的分析是重要的,而且在你时候的时候,可能会交叉使用。上面步骤中涉及了很多脚本,但都是很简单的文件内容提取比对。
这一期的内容比较多,涉及了实操和原理部分。部分只是想使用软件的同行来说,可以只看实际操作的代码部分。...这一期的内容比较多,涉及了实操和原理部分。部分只是想使用软件的同行来说,可以只看实际操作的代码部分。...
基于ICF的互联网康复医疗质控信息平台需求分析和架构设计.pdf
标签: 数据仓库
第1章 数据质量整体概述 1.1 概述 1.2. 数据质量标准分类 1.3 数据质量管理解决方案 第2章 ODS层数据校验 2.1 数据校验通用脚本 2.2 ODS层各表检验 第3章 DWD层数据校验 3.1 数据校验通用脚本 3.2 DWD层各...
DRGs数据采集与质量控制(PPT45页).ppt
前情提要NBT:QIIME 2可重复、交互和扩展的微生物组数据分析平台1简介和安装Introduction&Install2插件工作流程概述Workflow3老司机上路指南Exp...
接上一篇,数据拆分完成后,得到 FASTQ 文件,下面对数据进行质控。当前主流测序平台的数据存储格式无外乎两种,FASTQ(Illumina, MGI),BAM(Life Ion Tor...
移动医疗质控平台构建研究.pdf
PacBio是一家测序仪公司,提供第三代测序技术测序平台,他们的测序仪产生的数据,在业内叫PacBio数据或PacBio测序数据; Illumina是一家美国的测序仪公司,提供第二代测序技术测序平台,他们的测序仪产生的数据,在...
从原始数据到cleandata的处理过程中,首先需要进行质控和去除冗余序列。 质控是为了保证测序数据的质量和准确性。在测序过程中,可能会出现测序错误、测序深度不足等情况,因此需要对原始数据进行筛选和修复。常用...
医疗科技行业周报:卫健委发布新版病案质控指标,刺激医院加大IT开支.pdf
自己的学习笔记,欢迎各路大神批评指正 plink文件类型 Plink常见格式有五种:ped,map,bed,fam,bim PLINK接受VCF文件作为输入,但在PLINK中使用的首选格式是带有结尾.ped(和.map)的文件,以及带有结尾.bed(+ ...
为方便处理煤质检测中产生的大量煤标准物质数据,采用汇总表法以判断评审每台设备的d值是否超出标准煤样标准值的不确定范围,并采用曲线法对每台设备的一张或多张曲线图进行分析,可直观反应设备的运行情况、指导检测...
临床检验质控的自动化处理.pdf
trimmomatic处理Illumina 平台产生的fastq数据,支持fastq以及gzip 和 bzip2 压缩文件。 1. 处理PE数据 trimmomatic PE test_read1.fq test_read2.fq \ -phred33 \ out_read1.fq test_read1_unpaired.fq \ out...
包括选择使用有证标准物质作为实验室质控样品、确定控制图的类型、建立控制限以及确定控制分析的频度等,并采用日常质控图对煤中全硫、挥发分、发热量、氢等检测项目进行数据分析统计,以判断测试系统是否稳定可靠。...
单细胞分析流程之单细胞数据的预处理,包括数据读入,创建Seurat对象、质控等基本分析技术
早上联系到林同学,这厮除了骄傲地告诉俺他的论文答辩社会实践各等成绩校三好等破事外,重点知道了他目前在做关于数据质量控制的研究,并且下决心搞出点成绩。他的课题正好和俺目前做的事非常相似,我也是一有时间就...
点击蓝字 关注我们使用fastp进行超快的FASTQ数据预处理、质量控制和去重iMeta主页:http://www.imeta.science方法论文●原文链接DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.107● 2023年5月8日,海普洛斯生物科技有限公司陈...
标签: 其他
全面质量管理首先是全员参与的质控管理体系的建立,从委员会层面到质控职能管理组织,再到质控管理小组的建立,实现层级关系,并达到各类质控管理职能的区分,信息化实现是比较复杂的,要考虑人员多管理职能,而各个质控...
目录 1.什么是数据质量,我们遇到了什么问题 2.数据质量的问题和根源 2.1业务源系统变更 2.2 数据开发任务变更 ...2.3 物理资源不足或者基础设施不...发现数据问题,但是数据问题源头排查耗时长,导致数据长时间不可
Python在中医数据处理中的应用研究.pdf