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     微生物基因组重测序流程产品概述基本概念产品优势研究内容分析流程图数据产出及处理测序质量报告标准信息分析初级组装及评价比较基因组分析SNPCalling计算统计SNV的等位基因频率在全基因组上的分布分析对象包括全新...

     之前总结的有关Pacbio RSII测序数据QC的一些基本知识。 Part1.下机数据 用一个下机数据作为示例： 在analysis文件夹中，下机的数据被分割为三个文件进行存储，其中以bax.h5为后缀的是原始二进制文件；以...

     -phred33：表示测序平台使用的Phred quality score，phred33对应(Sanger/Illumina 1.9+ encoding)，-phred64对应(Illumina 1.5 encoding) 【还记得质控报告的基本信息那个框框吧，对的，就是在那看】-q：即--quality...

     目录质控使用 fastqc 批量质控使用 multiqc 整合 fastqc 的结果 质控 使用 fastqc 批量质控 find ./RAW/ERR*fastq.gz | xargs ./app/fastqc -t 6 -o ./fastqc_result 使用 multiqc 整合 fastqc 的结果 cd fastqc_...

     探讨ChIP-seq数据质量低的来源 理解链交叉相关性（ strand cross-correlation） 使用phantompeakqualtools计算交叉相关性和其他相关的质控度量值 评估交叉相关图 参考一：对ATAC-Seq/ChIP-seq的质量评估（一）——...

     PCA分析步骤： 第一步，对所有样本进行中心化 第二步，求特征协方差矩阵 第三步，求协方差矩阵的特征值和特征向量 第四步，将特征值按照从大到小的顺序排序，选择其中最大的k个，然后将其对应的k个特征向量分别...

      质控规则是解释质控数据和作出质控状态判断的决策标准。  质控规则以符号AL表示 A是测定质控标本数或超过质控限（L）的质控测定值的个 L是质控限。  当质控测定值超过质控规则所规定的质控限时，则判断该...

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     一种是在事务处理过程中，如果发生了某种错误则整个事务全部回滚，使所有对数据的修改全部撤销，事务对数据库的操作是单步执行的，当遇到错误时可以随时的回滚； 另一种是如果没有发生任何错误且每一步的执行都成功...

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