”【数据质控】“ 的搜索结果

     需要用安装好的sratoolkit把sra文件转换为fastq格式的测序文件，并且用fastqc软件测试测序文件的...之前下载了所有的数据，但只有样本915才是mRNA-Seq测序结果，其中9-11为人类293个AKAP9敲除细胞，12-15为小鼠的A...

     测序数据拿回来之后，会给一些数据。那么这些数据代表什么呢？ 1. 原始数据（Raw data）：一次测序产生的全部原始数据。理论上，它们应该是没有经过任何过滤的，无论好坏。...如果没有达到质控标准，则该read的...

     但是几乎所有的质控工具都是针对生成​MultiQC，基于Python的小工具能把多个质控结果整合，其强大的功能主要体现在以下三个方面：1）能将测序数据的多个QC结果整合成一个HTLM网页交互式报告，同时也能导出pdf文件；...

      趋势分析：近期数据是否有倾向性变化，变化是否有规律 d.项目分析：同一瓶质控其他项目是否也存在相同变化 ※通过违背的质控规则判断误差类型 ※寻找相应误差类型出现的可能原因 ※检查多测试系统是否具有共性...

     如果对其进行质控，用–maf 0.01，会去掉maf小于0.01的位点。《统计遗传学》中的章节介绍，有关代码实操部分，单独列出来，进行展示。缺失包括样本缺失率统计和位点缺失率统计。这里介绍一下常用的基因型数据清洗...

     Trim Galore是一个非常流行的用于「去接头序列」的软件，用于处理高通量测序得到的原始数据。通常我们从测序公司拿到数据后，第一步就是评估数据的质量以及对raw data去接头处理。公司拿来的数据通常附带了clean ...

10  
9  
8  
7  
6  
5  
4  
3  
2  
1  

推荐文章