#数据质控App##功能模块###质控校验1.提供四个选择(默认重复交验、跳过已校验数据、跳过已校验合格数据,跳过已校验不合格数据)###校验结果查询提供出入院时间、组织机构ID、院区ID,返回时间段内质控的结果表###...
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三医数据质控分析报告1
整理相关文档 查阅官方文档,可以用翻译软件翻译下载下来,在使用过程中完善文档,形成操作手册使用三医数据做一个质控分析,并形成质控报告1、测试汉化版本中的bug并
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管理任务,如启动、停止、删除任务。可以查看任务执行结果,如查询数据、查看汇总表格、可视化图形。数据参考如下需要梳理现有web程序调用的API,重新封装以供移动端
遇到问题启动项目总会存在编译问题,在之前接触过的同事帮助下解决了2020年12月31日完成工作熟悉桌面版的基本操作和桌面版的组件使用遇到问题组件较多,都是英文解
标签: 生物信息学
文章目录测序数据质控1.原始数据统计2.质控数据统计 测序数据质控 Illumina 测序属于第二代测序技术,单次运行能产生数十亿级的reads,如此海量的数据无法逐个展示每条read的质量情况;运用统计学的方法,对所测序列...
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一、功能清单序号一级功能模块二级功能模块说明完成情况端1质控对象(数据源)管理支持关系数据库、文档数据库、文本文件的数据源管理(包括各类关系数据库引擎的管理)完
RNA-seq数据质控、序列比对及sam文件的处理
数据下载及质控 GEO数据下载 GEOquery包安装 注意:需要R 4.0及以上 if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("GEOquery") .cel数据下载 ...
数据自治组件设计方案文档信息主题词文档版本2.0编写单位上海金仕达卫宁软件股份有限公司原作者马路文档类别技术文档审核文档性质一般批准发布日期主送存档日期抄送发行
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省三医监管平台数据质控分析1
数据流编排技术在绩效考核数据质控中的应用研究.docx
通过质控 、 NT 比 对,获得高质量的 clean data ,为后续分析奠定良好基础。 基因组 Survey 基于小片段文库的低深度测序数据( 50X 左右 通过 K mer 分析,有效的评估基因组大小、 GC 含量、杂合度以及重复...
数据质控的意义 现在的NGS测序,以illumina为首基本都是运用边合成边测序的技术。碱基的合成依靠的是化学反应,这使得碱基链可以不断地从5’端一直往3’端合成并延伸下去。但在这个合成的过程中随着合成链的增长,...
标签: mr
2. Per base sequence quility:每个测序read上各碱基质量 3. Per sequence quility scores:每条序列质
本文英文原版见下方github链接,由中科院朱微金博士翻译、测试、并进行中文注释和补充,全网首发“宏基因组”公众号。https://2017-cicese-metagenomics.re...
scuttle软件包为单细胞组学数据分析提供了一些实用功能。这包括一些计算和过滤质量控制的简单方法;基础数据转换涉及各种类型的缩放规范化;以及跨单元或功能的灵活聚合。 1.载入SingleCellExperiment数据 # if ...
数据质控 测序数据的产生经过了DNA提取、建库、测序等多个步骤,这些步骤会产生低质量或者无效的数据,需要对下机的原始数据进行质控。 1.原始序列数据解读 高通量测序得到的原始图像数据经过碱基识别(base calling...
本文英文原版见下方github链接,由中科院朱微金博士翻译、测试、并进行中文注释和补充,全网首发“宏基因组”公众号。...宏基因组分析理论教程 微生物组入门圣经+宏基因组分析实操课程 1.
标签: 学习
reads每个位置的颜色显示由4种颜色的比例混合而成,哪一个碱基的比例大,则趋近于这个碱基所代表的颜色。由下图可知32个样本的ATCG的含量比例是比较均匀的,测序质量是可以的。一条序列的重复数,因为一个转录组中有...
标签: 数据分析
看看新版fastp好用不,bbduk的复杂程度还是稍微有点高。